สำนักงานสิ่งแวดล้อมภาคที่ 6 นนทบุรี ได้ดำเนินการติดตาม ตรวจสอบและเฝ้าระวังคุณภาพน้ำแหล่งน้ำบริเวณแม่น้ำเจ้าพระยา คลองเชื่อมต่อแม่น้ำเจ้าพระยา และแม่น้ำภาคกลางได้แก่ แม่น้ำน้อย แม่น้ำป่าสัก และแม่น้ำลพบุรี รวมทั้งหมด 38 สถานี โดยวางแผนเก็บตัวอย่างน้ำ 4 ครั้งต่อปี คือ ครั้งที่ 1(วันที่ 24 - 27 พฤศจิกายน 2551) ครั้งที่ 2 (วันที่ 2 - 5 มีนาคม 2552) ครั้งที่ 3 (วันที่ 25 - 28 พฤษภาคม 2552) และครั้งที่ 4 (วันที่ 20 - 23 กรกฎาคม 2552) ได้กำหนดสถานีตรวจสอบคุณภาพน้ำดังนี้

1. แม่น้ำเจ้าพระยา (CH) ดำเนินการ ติดตาม ตรวจสอบ คุณภาพน้ำแหล่งน้ำจำนวน 17 สถานี โดยแบ่งเป็นช่วงที่ 1 (ตอนล่าง) มี 6 สถานี ช่วงที่ 2 (ตอนกลาง) มี 5 สถานี และช่วงที่ 3 (ตอนบน) มี 6 สถานี